مطهری تلویحاً پاسداران را مسئول شکست برجام و اوضاع کنونی کشور دانست

علی مطهری که این سخن را در مخالفت با طرح مسألۀ عدم کفایت رئیس جمهوری در مجلس ایراد می کرد، اظهار داشت : "مسئول وضعیت جاری کشور آنهایی هستند که با هوا کردن موشک تلاش نمودند برجام اجرا نشود که البته به هدف شان نیز رسیدند."

علی مطهری تصریح کرده است که کل نظام اسلامی ایران از آغاز در اجرای برجام مصمم نبود. به گفتۀ او "اگر همه تلاش می کردند برجام درست اجرا شود امروز بسیاری از شرکت های اروپایی و آمریکایی که وارد ایران شدند، در ایران می ماندند و سرمایه گذاری می کردند و ترامپ هم نمی توانست به آسانی از برجام خارج شود."

به گفتۀ نایب رئیس مجلس شورای اسلامی ایران، بخشی از حاکمیت جمهوری اسلامی از آغاز مایل به اجرای برجام نبود و عاقبت هم به هدف خود رسید. او مسبب و مسئول مشکلات کنونی کشور را همین بخش از حاکمیت جمهوری اسلامی دانست و افزود : "وضعیت جاری کشور تفصیر دلواپسان و همه کسانی است که تلاش کردند برجام اجرا نشود"، هر چند به گفتۀ علی مطهری، سوءمدیریت دولت روحانی نیز در عدم اجرای برجام بی نقش نبوده است.

علی مطهری در جای دیگری از سخنانش در واکنش به تمایل رئیس جمهوری آمریکا برای مذاکره با رهبران ایران، گفت : در وضعیت فعلی، مذاکره با دونالد ترامپ نتیجه ای جز تحقیر و خواری و ذلت جمهوری اسلامی ایران ندارد. او گفته است : اگر ترامپ از برجام خارج نشده بود و تحریم های جدیدی علیه ایران به تصویب نرسانده بود، مذاکره با او اشکال نداشت. با این حال، علی مطهری گفته است : بهتر می بود که جمهوری اسلامی در زمان اوباما با آمریکا برای حل همۀ مشکلات و مسائل‌اش با این کشور مذاکره می کرد. رهبر جمهوری اسلامی ایران، علی خامنه ای، در زمان ریاست جمهوری باراک اوباما هر گونه مذاکره با آمریکا را خارج از مسئلۀ هسته ای اکیداً منع کرده بود.